Андрей Пивоваров / Давид Френкель
Генеральная прокуратура России 26 апреля 2017 года признала нежелательными ряд организаций, связаных с Михаилом Ходорковским. В список вошли зарегистрированные в Великобритании «Открытая Россия» (OR Otkrytaya Rossia) и Общественное сетевое движение «Открытая Россия» (Open Russia Civic Movement, Open Russia), «Институт современной России» (Institute of Modern Russia, Inc) — оформленный в США.
Российское движение «Открытая Россия» запрещено не было. Тем не менее в декабре 2017 года Роскомнадзор внес сайт медиа-проекта «Открытая Россия» в реестр запрещенных. Доступ закрыли к сайтам «Открытые выборы», «Открытый университет» и khodorkovsky.ru.
Кроме того, полиция стала преследовать участников российского движения. В большинстве случаев их обвиняют в сотрудничестве с «нежелательной организацией», то есть с зарегистрированной в Великобритании, к которой они не имеют отношения.
В январе 2019 года против члена федерального совета «Открытой России» Анастасии Шевченко возбудили первое уголовное дело по статье об осуществлении деятельности организации, признанной нежелательной на территории России (ст. 284.1 УК).
По состоянию на июнь 2021 года было возбуждено девять уголовных дел о причастности к «нежелательной организации» в связи с «Открытой Россией», последним стало дело бывшего директора Андрея Пивоварова.